Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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