Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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