Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CQC3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms