Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms