Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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