Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms