Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rwdd4Q9CPR1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rwdd4Q9CPR1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rwdd4Q9CPR1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rwdd4Q9CPR1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rwdd4Q9CPR1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rwdd4Q9CPR1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms