Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms