Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms