Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf17Q99MV7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms