Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms