Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ophn1Q99J31 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ophn1Q99J31 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms