Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms