Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCB1

Ndc1, Nucleoporin NDC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc1Q8VCB1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndc1Q8VCB1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndc1Q8VCB1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms