Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC82

Rhbdl1, Rhomboid-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl1Q8VC82 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdl1Q8VC82 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdl1Q8VC82 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdl1Q8VC82 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms