Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
McmbpQ8R3C0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms