Protein–RNA interactions for Protein: Q8R310

Tmcc3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc3Q8R310 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmcc3Q8R310 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmcc3Q8R310 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms