Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxc12Q8K5B8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxc12Q8K5B8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxc12Q8K5B8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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