Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sde2Q8K1J5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms