Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Stx5Q8K1E0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx5Q8K1E0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms