Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip10Q8CJ53 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms