Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms