Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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Card11Q8CIS0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Card11Q8CIS0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Card11Q8CIS0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms