Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps50Q8CI71 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms