Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp2Q8CGR7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms