Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arhgap29Q8CGF1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arhgap29Q8CGF1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms