Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ercc8Q8CFD5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ercc8Q8CFD5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ercc8Q8CFD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ercc8Q8CFD5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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