Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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