Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RybpQ8CCI5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms