Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo48Q8CAT8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms