Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms