Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
4930507D05RikQ8C9C9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms