Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dclre1bQ8C7W7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms