Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms