Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms