Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Trim35Q8C006 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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