Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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