Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PgghgQ8BP56 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PgghgQ8BP56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PgghgQ8BP56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PgghgQ8BP56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PgghgQ8BP56 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PgghgQ8BP56 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PgghgQ8BP56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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