Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms