Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp1Q8BJQ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms