Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms