Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ubash3bQ8BGG7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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