Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Lrrtm2Q8BGA3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lrrtm2Q8BGA3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Lrrtm2Q8BGA3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lrrtm2Q8BGA3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lrrtm2Q8BGA3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm2Q8BGA3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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