Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cracr2bQ80ZJ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms