Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc1Q80VQ1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Lrrc1Q80VQ1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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