Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pja2Q80U04 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms