Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clec18aQ7TSQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clec18aQ7TSQ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clec18aQ7TSQ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms