Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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