Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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