Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms